Skip to main content

Table 2 Polymorphic sites of 34 haplotypes of ten Lu. longipalpis s.l. populations from the Eastern Brazil.

From: Lutzomyia longipalpis s.l. in Brazil and the impact of the Sao Francisco River in the speciation of this sand fly vector

Haplotypes Segregating sites Number of haplotypes in each population
          1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 2    N P J I C J   M F P
  2 3 4 5 6 6 8 9 0 0 1 4 4 4 5 5 5 5 6 6 7 9 9 9 4 5    T T P T L Z   S S N
  6 6 8 3 0 9 1 9 2 5 1 1 4 7 0 3 6 9 1 2 4 0 2 3 0 4    L S S A B R   T N C
Ll-1 T C T G T T G T A T T A G A T T A C C C C G A T A A    2    1   1    1 4
Ll-2 . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . .    1      1   7   
Ll-3 . . . . . . . . . . . . . . . . . T . T . . . . G .       3   3     
Ll-4 . . . . . . . . . . . G . . C A G T . T . . . . . .         1     
Ll-5 . . . . . . A C . C . . A . . . . . . T T . . . . .         1     
Ll-7 . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . .    1      3    1 6
Ll-8 . . . . . . A . . . . G . . . . . . . . . . . . . .    2     1 1     
Ll-9 . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . .    1 1   4   2     
Ll-10 . . . . . . A . . . . G . . . . . T . T . . . . . .    2 1     1     
Ll-12 . . . . . . . . G . . G . . . . G T . T . . . . . .         1     
Ll-13 . . . . C . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . .         1     
Ll-14 . . . . . . . . . . . G A . . . . . . . . . . . . .    1        1 1  
Ll-15 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . .    4   1        
Ll-16 . . . . . . A . . . . G . . . . . T . T T . . . . .    1          
Ll-17 . . . . . . . . . . . G . . . . . T . T . . . . . .    1          
Ll-18 . . . . . . A . . . . G A . . . . . . . . . . . . .    1         2  
Ll-19 . . . . . . A . . . . G A . . . . T . T T . . . . .    1          
Ll-20 . . . . . . . . . . . . . . . . . T . T T . . . . .    1          
Ll-21 . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . T . . . . .    1          
Ll-22 . . . A . . . . . . . G . . . . . T . . . . . . . .             3
Ll-23 . . . . . . . . . . . G . . . . . T . . T . . . . .             1
Ll-24 . . . . . . . . . . . G . . . . . T . . . . . . . .             2
Ll-25 . . . . . . . . . . . . . . . . . T . T . . . . . .       1       
Ll-26 . . . . . . . . . C . . . . . . . . . T . . . . G .       1       
Ll-27 . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . .       1       
Ll-29 . . . . . . . . . . . G . G . . . . . . . . . . . .            1  
Ll-30 . . C . . . . . . . . G A . . . . . . . . . . . . .            1  
Ll-31 . . . . . . A . . . . G . . . . . . . T . . . C . .            1  
Ll-32 . . . . . . A . . . . G . . . . . . . T . A . C . .           1   
Ll-33 . . . . . . A . . . . G . . . . . . . . . . G . . .           1   
Ll-34 . . . . . . A . . . . . A . . . . . . . T . . . . .        1      
Ll-35 . . . . . . A . . . . G . . . . G T . T . . . . . .        1      
Ll-36 . T . . . C . . . . C . . . . . . . . . . . . . . .      1        
Ll-37 . . . . . . . . . . . G . . . . . T . T T . . . . .     1         
  1. Lu. longipalpis s.l. populations are indicated by a vertival 3 letter code: Natal (NTL), Patos (PTS), João Pessoa (JPS), Itamaracá (ITA), Calumbi (CLB), Juazeiro (JZR), Monte Santo (MST), Feira de Santana (FST) and Pancas (PNC). GenBank accession numbers for haplotypes Ll-1 to Ll-33 were reported in [26, 27]. GenBank accession numbers for Ll-34 to Ll-37 are EF107662 to EF107665, respectively.