Skip to main content

Table 3 Pairwise genetic distances between Haplosporidium diporeiae n. sp. and similar haplosporidians based the partial 16S small subunit rDNA sequences used for phylogenetic analysis

From: Molecular and ultrastructural characterization of Haplosporidium diporeiae n. sp., a parasite of Diporeia sp. (Amphipoda, Gammaridea) in the Laurentian Great Lakes (USA)

Haplosporidium diporeia n. sp.                      
H. nelsoni (U19538) 0.12                     
H. nelsoni (AB080597) 0.13 0.00                    
H. nelsoni (X74131) 0.13 0.01 0.01                   
H. costale (AF387122) 0.13 0.15 0.15 0.15                  
H. costalegi (U20858) 0.14 0.15 0.15 0.15 0.01                 
H. edule (DQ458793) 0.16 0.18 0.18 0.18 0.14 0.15                
H. raabei (HQ176469) 0.17 0.18 0.18 0.18 0.15 0.16 0.05               
H. tuxtlensis (JN368430) 0.18 0.19 0.19 0.19 0.16 0.17 0.17 0.17              
H. lusitanicum (AY449713) 0.17 0.17 0.17 0.17 0.15 0.15 0.17 0.17 0.09             
H. montforti (DQ219484) 0.17 0.17 0.17 0.17 0.15 0.15 0.17 0.17 0.09 0.00            
H. pickfordi (AY452724) 0.18 0.18 0.18 0.18 0.15 0.16 0.15 0.15 0.04 0.09 0.09           
H. louisiana (U47851) 0.25 0.25 0.25 0.25 0.25 0.25 0.26 0.26 0.27 0.26 0.26 0.27          
Bonamia exitiosa (JF495410) 0.13 0.14 0.14 0.14 0.14 0.14 0.15 0.16 0.17 0.15 0.15 0.16 0.25         
Bonamia perspora (DQ356000) 0.14 0.15 0.15 0.15 0.14 0.15 0.16 0.16 0.18 0.16 0.16 0.16 0.25 0.03        
Minchinia chitonis (AY449711) 0.16 0.17 0.17 0.17 0.17 0.17 0.19 0.18 0.20 0.19 0.19 0.20 0.26 0.16 0.17       
Minchinia teredinis (U20319) 0.18 0.17 0.17 0.17 0.17 0.17 0.18 0.18 0.18 0.18 0.18 0.17 0.26 0.16 0.16 0.11      
Urosporidium sp. (AY449714) 0.20 0.21 0.21 0.21 0.21 0.21 0.22 0.22 0.24 0.22 0.22 0.23 0.27 0.21 0.21 0.22 0.24     
Urosporidium crescens (U47852) 0.20 0.21 0.21 0.21 0.21 0.22 0.22 0.22 0.24 0.22 0.22 0.23 0.28 0.21 0.22 0.22 0.23 0.04    
Perkinsus chesapeaki (AF042707) 0.22 0.23 0.24 0.24 0.23 0.23 0.24 0.26 0.24 0.23 0.23 0.24 0.30 0.23 0.24 0.23 0.25 0.22 0.22   
Perkinsus marinus (AF042708) 0.22 0.24 0.24 0.24 0.23 0.23 0.25 0.26 0.25 0.24 0.24 0.24 0.30 0.23 0.24 0.23 0.25 0.23 0.22 0.02  
Cercomonas longicauda (AF101052) 0.24 0.24 0.24 0.24 0.24 0.24 0.25 0.25 0.26 0.24 0.24 0.25 0.30 0.22 0.23 0.24 0.24 0.22 0.22 0.17 0.17