Skip to main content

Advertisement

Table 1 Genotyping results of T. gondii DNA with 15 microsatellite markers from 33 isolates collected in sheep and goats of Central Ethiopia and from 14 reference strains collected in America, Africa, Asia, and Europe

From: Isolation and genotyping of viable Toxoplasma gondii from sheep and goats in Ethiopia destined for human consumption

     Microsatellite markers1
Isolate Type Origin Host TUB2 W35 TgM-A B18 B17 M33 IV.1 XI.1 M48 M102 N60 N82 AA N61 N83
TgSpEt2 II W.Shewa Sheep 289 242 207 158 336 169 274 356 NA 176 NA NA NA NA NA
TgSpEt3 II W.Shewa Sheep 289 242 207 158 336 169 274 356 211 176 140 123 259 091 308
TgSpEt4 II W.Shewa Sheep 289 242 207 158 336 169 274 356 211 176 140 123 259 091 308
TgGtEt1 II W.Shewa Goat 289 242 207 158 336 169 274 356 225 172 142 117 259 093 308
TgGtEt2 II W.Shewa Goat 289 242 207 158 336 169 274 356 235 176 138 115 279 099 312
TgGtEt3 II W.Shewa Goat 289 242 207 158 336 169 274 356 235 176 138 115 279 099 312
TgGtEt5 III E.Shewa Goat 289 242 205 160 336 165 278 356 213 190 147 113 267 089 312
TgGtEt4 II W.Shewa Goat 289 242 207 158 336 169 274 356 237 176 140 113 273 093 312
TgSpEt6 II W.Shewa Sheep 289 242 207 158 336 169 274 356 213 176 140 115 265 117 308
TgGtEt8 II E.Shewa Goat 289 242 207 158 336 169 274 356 211 178 142 109 285 085 310
TgGtEt212 II E.Shewa Goat NA 242 NA 158 336 NA NA 356 NA NA NA NA NA NA 312
TgGtEt222 II E.Shewa Goat NA 242 NA 158 NA NA 274 NA NA NA NA NA 279 NA 312
TgGtEt12 II E.Shewa Goat 289 242 207 158 336 169 274 356 213 176 140 115 261 089 308
TgSpEt10 II E.Shewa Sheep 289 NA 207 158 336 169 274 NA NA NA NA NA NA NA 312
TgSpEt282 II E.Shewa Sheep 289 242 207 158 336 169 274 356 213 176 140 115 261 089 308
TgGtEt14 II E.Shewa Goat 289 242 207 158 336 169 274 356 233 174 140 113 269 097 312
TgGtEt13 II E.Shewa Goat 289 242 207 158 336 169 274 NA NA NA 140 113 NA NA NA
TgSpEt19 Atypical E.Shewa Sheep 289 240 201 156 340 163 272 360 209 218 147 127 283 099 342
TgGtEt17 III E.Shewa Goat 289 242 205 160 336 165 278 356 213 190 147 113 267 089 312
TgSpEt18 II E.Shewa Sheep 289 242 207 158 336 169 274 356 211 176 140 109 267 091 308
TgGtEt16 II E.Shewa Goat 289 242 207 158 336 169 274 356 211 176 140 109 267 091 308
TgSpEt22 II E.Shewa Sheep 289 242 207 158 336 169 274 356 219 176 140 111 267 097 310
TgSpEt20 II E.Shewa Sheep 289 242 207 158 336 169 274 356 213 178 140 115 261 091 308
TgSpEt21 II E.Shewa Sheep 289 242 207 158 336 169 274 356 211 176 140 109 267 091 308
TgGtEt19 II E.Shewa Goat 289 242 207 158 336 169 274 356 215 176 138 117 267 099 312
TgSpEt23 III E.Shewa Sheep 289 242 205 160 336 165 278 356 213 190 147 111 271 089 312
TgSpEt25 II E.Shewa Sheep 289 242 207 158 336 169 274 356 211 176 140 121 267 091 308
TgSpEt26 II E.Shewa Sheep 289 242 207 158 336 169 274 356 239 176 138 115 281 097 310
TgSpEt27 II E.Shewa Sheep 289 242 207 158 336 169 274 356 213 176 140 123 259 091 308
TgGtEt20 II E.Shewa Goat 289 242 207 158 336 169 274 356 213 176 140 115 261 089 308
TgSpEt7 II W.Shewa Sheep 289 242 207 158 336 169 274 356 225 172 142 117 261 093 308
TgSpEt8 II W.Shewa Sheep 289 242 207 158 336 169 274 356 213 178 140 115 265 089 308
TgSpEt9 II W.Shewa Sheep 289 242 207 158 336 169 274 356 NA NA 140 115 NA NA 316
GAB5-GAL-DOM01 Africa 1 Gabon Chicken 291 248 205 160 342 165 274 354 231 166 149 111 277 087 306
CCH002-NIA Africa 2 Senegal Human 289 248 205 160 336 165 274 354 225 166 145 111 273 089 308
GAB2-GAL-DOM02 Africa 3 Gabon Human 291 242 207 160 342 165 278 354 223 166 142 111 277 097 310
ENT I France Human 291 248 209 160 342 169 274 358 209 166 145 119 267 087 306
ME49 II USA Sheep 289 242 207 158 336 169 274 356 215 174 142 111 265 091 310
NED III France Human 289 242 205 160 336 165 278 356 209 190 147 111 267 091 312
VAND Atypical French Guiana Human 291 242 203 162 344 167 276 356 217 170 142 113 277 091 308
GUY-CAN-FAM01 Caribbean 1 French Guiana Dog 291 242 205 162 342 165 278 356 213 164 142 109 265 087 312
TgCtPRC04 Chinese 1 China Cat 293 242 211 160 336 169 274 354 215 172 145 123 281 093 308
TgCatBr01 BR II Brazil Cat 289 242 205 160 342 165 278 358 233 164 147 111 316 089 308
TgCatBr03 BR III Brazil Cat 289 242 205 160 348 165 278 356 213 190 142 111 263 113 312
TgCatBr05 Atypical Brazil Cat 291 242 205 160 362 165 278 356 237 174 140 111 265 089 314
TgCatBr15 Atypical Brazil Cat 289 242 205 162 344 165 278 358 225 164 142 111 263 105 312
TgCkBr81 BR IV Brazil Chicken 291 246 207 162 362 169 272 358 217 164 142 105 322 081 314
  1. W. Shewa = West Shewa Zone, E. Shewa = East Shewa Zone.
  2. 1NA, not amplified, 2 cyst negative but nPCR positive.