Skip to main content

Table 1 Comparison of HRM assay and PCR-RFLP/MLEE in the set of well-characterized Leishmania strains

From: Identification of Six New World Leishmania species through the implementation of a High-Resolution Melting (HRM) genotyping assay

Sample name Geographical origin Host PCR-RFLP/MLEE HSP70 Tm ITS1 Tm
6 Meta/Colombia Homo sapiens L. guyanensis L. guyanensis/L. braziliensis 90,08 L. guyanensis 79,22
7 Santander/Colombia Lutzomyia umbratilis L. guyanensis L. guyanensis/L. braziliensis 90,07 L. guyanensis 79,21
71 Boyaca/Colombia Lutzomyia umbratilis L. guyanensis L. guyanensis/L. braziliensis 90,07 L. guyanensis 79,23
875 Santander/Colombia Homo sapiens L. infantum (chagasi) L. guyanensis/L. braziliensis 90,07 L. chagasi 79,21
924 Santander/Colombia Homo sapiens L. panamensis L. panamensis 89,91 L. panamensis -
113 Meta/Colombia Homo sapiens L. braziliensis L. guyanensis/L. braziliensis 90,08 L. braziliensis 78,77
12 Boyaca/Colombia Homo sapiens L. braziliensis L. guyanensis/L. braziliensis 90,09 L. braziliensis 78,55
13 Boyaca/Colombia Homo sapiens L. guyanensis L. guyanensis/L. braziliensis 90,06 L. guyanensis 79,22
15 Boyaca/Colombia Didelphis marsupialis L. panamensis L. panamensis 89,73 L. panamensis -
19 Meta/Colombia Lutzomyia spinicrassa L. braziliensis L. guyanensis/L. braziliensis 90,09 L. braziliensis 78,77
20 Meta/Colombia Lutzomyia trapidoi L. panamensis L. panamensis 89,73 L. panamensis -
21 Meta/Colombia Lutzomyia trapidoi L. panamensis L. panamensis 89,83 L. panamensis -
23 Meta/Colombia Lutzomyia trapidoi L. panamensis L. panamensis 89,73 L. panamensis -
86 Santander/Colombia Homo sapiens L. infantum (chagasi) L. infantum/L. amazonensis 89,14 L. chagasi 78,33
87 Santander/Colombia Homo sapiens L. infantum (chagasi) L. infantum/L. amazonensis 89,17 L. chagasi 78,56
94 Santander/Colombia Homo sapiens L. infantum (chagasi) L. infantum/L. amazonensis 89,19 L. chagasi 78,55
094b Antioquia/Colombia Didelphis marsupialis L. mexicana L. mexicana 88,75 L. mexicana -
245 Antioquia/Colombia Homo sapiens L. amazonensis L. infantum/L. amazonensis 89,19 L. amazonensis 80,61
280 Antioquia/Colombia Homo sapiens L. amazonensis L. infantum/L. amazonensis 89,19 L. amazonensis 80,77
916 Antioquia/Colombia Lutzomyia trapidoi L. panamensis L. panamensis 89,79 L. panamensis -
916 Antioquia/Colombia Lutzomyia trapidoi L. panamensis L. panamensis 89,73 L. panamensis -
984 Antioquia/Colombia Homo sapiens L. braziliensis L. guyanensis/L. braziliensis 90,04 L. braziliensis 78,77
985 Antioquia/Colombia Lutzomyia spinicrassa L. braziliensis L. guyanensis/L. braziliensis 90,08 L. braziliensis 78,89
986 Meta/Colombia Homo sapiens L. braziliensis L. guyanensis/L. braziliensis 90,09 L. braziliensis 78,91
990 Meta/Colombia Homo sapiens L. guyanensis L. guyanensis/L. braziliensis 90,04 L. guyanensis 79,22
094b Meta/Colombia Homo sapiens L. infantum (chagasi) L. infantum/L. amazonensis 89,22 L. chagasi 78,67
094b Meta/Colombia Homo sapiens L. infantum (chagasi) L. infantum/L. amazonensis 89,29 L. chagasi 78,66
101 Boyaca/Colombia Homo sapiens L. amazonensis L. infantum/L. amazonensis 89,14 L. amazonensis 81,11
123 Boyaca/Colombia Homo sapiens L. braziliensis L. guyanensis/L. braziliensis 90,02 L. braziliensis 78,66
157 Santander/Colombia Homo sapiens L. guyanensis L. guyanensis/L. braziliensis 90,04 L. guyanensis 79,22
146 Santander/Colombia Homo sapiens L. guyanensis L. guyanensis/L. braziliensis 90,01 L. guyanensis 79,22
147 Santander/Colombia Didelphis marsupialis L. mexicana L. mexicana 88,37 L. mexicana -
222 Santander/Colombia Homo sapiens L. panamensis L. panamensis 89,82 L. panamensis -
2698 Santander/Colombia Homo sapiens L. panamensis L. panamensis 89,81 L. panamensis -
1453 Santander/Colombia Lutzomyia trapidoi L. panamensis L. panamensis 89,88 L. panamensis -