Table 1 Comparison of HRM assay and PCR-RFLP/MLEE in the set of well-characterized Leishmania strains
Sample name | Geographical origin | Host | PCR-RFLP/MLEE | HSP70 | Tm | ITS1 | Tm |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
6 | Meta/Colombia | Homo sapiens | L. guyanensis | L. guyanensis/L. braziliensis | 90,08 | L. guyanensis | 79,22 |
7 | Santander/Colombia | Lutzomyia umbratilis | L. guyanensis | L. guyanensis/L. braziliensis | 90,07 | L. guyanensis | 79,21 |
71 | Boyaca/Colombia | Lutzomyia umbratilis | L. guyanensis | L. guyanensis/L. braziliensis | 90,07 | L. guyanensis | 79,23 |
875 | Santander/Colombia | Homo sapiens | L. infantum (chagasi) | L. guyanensis/L. braziliensis | 90,07 | L. chagasi | 79,21 |
924 | Santander/Colombia | Homo sapiens | L. panamensis | L. panamensis | 89,91 | L. panamensis | - |
113 | Meta/Colombia | Homo sapiens | L. braziliensis | L. guyanensis/L. braziliensis | 90,08 | L. braziliensis | 78,77 |
12 | Boyaca/Colombia | Homo sapiens | L. braziliensis | L. guyanensis/L. braziliensis | 90,09 | L. braziliensis | 78,55 |
13 | Boyaca/Colombia | Homo sapiens | L. guyanensis | L. guyanensis/L. braziliensis | 90,06 | L. guyanensis | 79,22 |
15 | Boyaca/Colombia | Didelphis marsupialis | L. panamensis | L. panamensis | 89,73 | L. panamensis | - |
19 | Meta/Colombia | Lutzomyia spinicrassa | L. braziliensis | L. guyanensis/L. braziliensis | 90,09 | L. braziliensis | 78,77 |
20 | Meta/Colombia | Lutzomyia trapidoi | L. panamensis | L. panamensis | 89,73 | L. panamensis | - |
21 | Meta/Colombia | Lutzomyia trapidoi | L. panamensis | L. panamensis | 89,83 | L. panamensis | - |
23 | Meta/Colombia | Lutzomyia trapidoi | L. panamensis | L. panamensis | 89,73 | L. panamensis | - |
86 | Santander/Colombia | Homo sapiens | L. infantum (chagasi) | L. infantum/L. amazonensis | 89,14 | L. chagasi | 78,33 |
87 | Santander/Colombia | Homo sapiens | L. infantum (chagasi) | L. infantum/L. amazonensis | 89,17 | L. chagasi | 78,56 |
94 | Santander/Colombia | Homo sapiens | L. infantum (chagasi) | L. infantum/L. amazonensis | 89,19 | L. chagasi | 78,55 |
094b | Antioquia/Colombia | Didelphis marsupialis | L. mexicana | L. mexicana | 88,75 | L. mexicana | - |
245 | Antioquia/Colombia | Homo sapiens | L. amazonensis | L. infantum/L. amazonensis | 89,19 | L. amazonensis | 80,61 |
280 | Antioquia/Colombia | Homo sapiens | L. amazonensis | L. infantum/L. amazonensis | 89,19 | L. amazonensis | 80,77 |
916 | Antioquia/Colombia | Lutzomyia trapidoi | L. panamensis | L. panamensis | 89,79 | L. panamensis | - |
916 | Antioquia/Colombia | Lutzomyia trapidoi | L. panamensis | L. panamensis | 89,73 | L. panamensis | - |
984 | Antioquia/Colombia | Homo sapiens | L. braziliensis | L. guyanensis/L. braziliensis | 90,04 | L. braziliensis | 78,77 |
985 | Antioquia/Colombia | Lutzomyia spinicrassa | L. braziliensis | L. guyanensis/L. braziliensis | 90,08 | L. braziliensis | 78,89 |
986 | Meta/Colombia | Homo sapiens | L. braziliensis | L. guyanensis/L. braziliensis | 90,09 | L. braziliensis | 78,91 |
990 | Meta/Colombia | Homo sapiens | L. guyanensis | L. guyanensis/L. braziliensis | 90,04 | L. guyanensis | 79,22 |
094b | Meta/Colombia | Homo sapiens | L. infantum (chagasi) | L. infantum/L. amazonensis | 89,22 | L. chagasi | 78,67 |
094b | Meta/Colombia | Homo sapiens | L. infantum (chagasi) | L. infantum/L. amazonensis | 89,29 | L. chagasi | 78,66 |
101 | Boyaca/Colombia | Homo sapiens | L. amazonensis | L. infantum/L. amazonensis | 89,14 | L. amazonensis | 81,11 |
123 | Boyaca/Colombia | Homo sapiens | L. braziliensis | L. guyanensis/L. braziliensis | 90,02 | L. braziliensis | 78,66 |
157 | Santander/Colombia | Homo sapiens | L. guyanensis | L. guyanensis/L. braziliensis | 90,04 | L. guyanensis | 79,22 |
146 | Santander/Colombia | Homo sapiens | L. guyanensis | L. guyanensis/L. braziliensis | 90,01 | L. guyanensis | 79,22 |
147 | Santander/Colombia | Didelphis marsupialis | L. mexicana | L. mexicana | 88,37 | L. mexicana | - |
222 | Santander/Colombia | Homo sapiens | L. panamensis | L. panamensis | 89,82 | L. panamensis | - |
2698 | Santander/Colombia | Homo sapiens | L. panamensis | L. panamensis | 89,81 | L. panamensis | - |
1453 | Santander/Colombia | Lutzomyia trapidoi | L. panamensis | L. panamensis | 89,88 | L. panamensis | - |