Haplotype codes and isolates | GenBank acc. no. | 1 | 2 | 3 | 4 | 5 | 6 | 7 | 8 | 9 | 10 | 11 | 12 | 13 | 14 | 15 | 16 | 17 | 18 | 19 | 20 |
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1. L. neotropica L.neo-16SA | HE610433 | ||||||||||||||||||||
2. L. neotropica L.neo-16SA | KT226115 | 0 | |||||||||||||||||||
3. L. neotropica isolate NtS1 | JN872471 | 8 | 8 | ||||||||||||||||||
4. L. neotropica isolate NtS2 | JN872472 | 1 | 1 | 9 | |||||||||||||||||
5. L. neotropica isolate NtS3 | JN872473 | 0 | 0 | 8 | 1 | ||||||||||||||||
6. L. neotropica isolate NtS4 | JN872474 | 5 | 5 | 9 | 5 | 5 | |||||||||||||||
7. L. viator L.via-16SA | HE610434 | 5 | 5 | 13 | 6 | 5 | 10 | ||||||||||||||
8. L. viator L.via-16SB | KT215352 | 5 | 5 | 13 | 6 | 5 | 10 | 0 | |||||||||||||
9. L. viator isolate VxS2 | JN872460 | 5 | 5 | 13 | 6 | 5 | 10 | 0 | 0 | ||||||||||||
10. L. viator isolate VxS9 | JN872467 | 6 | 6 | 14 | 7 | 6 | 11 | 1 | 1 | 1 | |||||||||||
11. L. viator isolate VxS8 | JN872466 | 4 | 4 | 12 | 5 | 4 | 9 | 1 | 1 | 1 | 2 | ||||||||||
12. L. viator isolate VxS10 | JN872468 | 5 | 5 | 12 | 6 | 5 | 10 | 2 | 2 | 2 | 3 | 1 | |||||||||
13. L. viator isolate VxS4 | JN872462 | 7 | 7 | 11 | 8 | 7 | 12 | 2 | 2 | 2 | 3 | 3 | 4 | ||||||||
14. L. viator isolate VxS12 | JN872470 | 5 | 5 | 11 | 6 | 5 | 10 | 2 | 2 | 2 | 3 | 1 | 2 | 4 | |||||||
15. L. viator isolate VxS6 | JN872464 | 10 | 10 | 12 | 11 | 10 | 11 | 5 | 5 | 5 | 4 | 6 | 7 | 7 | 7 | ||||||
16. L. viator isolate VxS5 | JN872463 | 8 | 8 | 10 | 9 | 8 | 13 | 3 | 3 | 3 | 4 | 4 | 5 | 1 | 5 | 8 | |||||
17. L. viator isolate VxS11 | JN872469 | 9 | 9 | 11 | 10 | 9 | 8 | 6 | 6 | 6 | 7 | 5 | 6 | 8 | 6 | 3 | 9 | ||||
18. L. viator isolate VxS3 | JN872461 | 11 | 11 | 13 | 10 | 11 | 11 | 6 | 6 | 6 | 5 | 7 | 8 | 8 | 8 | 1 | 9 | 4 | |||
19. L. viator isolate VxS7 | JN872465 | 9 | 9 | 12 | 10 | 9 | 14 | 4 | 4 | 4 | 5 | 5 | 4 | 2 | 6 | 9 | 3 | 10 | 10 | ||
20. L. viator isolate VxS1 | JN872459 | 9 | 9 | 11 | 10 | 9 | 8 | 4 | 4 | 4 | 5 | 5 | 6 | 6 | 6 | 3 | 7 | 2 | 4 | 8 |