Haplotype codes and isolates | GenBank acc. no. | 1 | 2 | 3 | 4 | 5 | 6 | 7 | 8 | 9 | 10 | 11 | 12 | 13 | 14 | 15 | 16 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
1. L. neotropica L.neo-cox1a | AM494008 | ||||||||||||||||
2. L. neotropica L.neo-cox1b | FN356741 | 1 | |||||||||||||||
3. L. neotropica L.neo-cox1c | JF461485 | 6 | 7 | ||||||||||||||
4. L. neotropica L.neo-cox1d | JF461486 | 70 | 71 | 72 | |||||||||||||
5. L. neotropica L.neo-cox1e | KT215350 | 0 | 1 | 6 | 70 | ||||||||||||
6. L. neotropica isolate NtC1 | JN872452 | 1 | 2 | 7 | 71 | 1 | |||||||||||
7. L. neotropica isolate NtC2 | JN872453 | 0 | 1 | 6 | 70 | 0 | 1 | ||||||||||
8. L. neotropica isolate NtC3 | JN872454 | 1 | 2 | 7 | 71 | 1 | 2 | 1 | |||||||||
9. L. viator ventr. L.via-cox1a | AM494010 | 28 | 29 | 33 | 66 | 28 | 29 | 28 | 27 | ||||||||
10. L. viator L.via-cox1b | JN051373 | 33 | 34 | 38 | 70 | 33 | 34 | 33 | 34 | 11 | |||||||
11. L. viator L.via-cox1c | JN051374 | 34 | 35 | 39 | 71 | 34 | 35 | 34 | 35 | 12 | 1 | ||||||
12. L. viator L.via-cox1d | KT215351 | 29 | 30 | 32 | 65 | 29 | 30 | 29 | 28 | 5 | 12 | 13 | |||||
13. L. viator isolate VxC1 | JN872449 | 29 | 30 | 32 | 65 | 29 | 30 | 29 | 28 | 7 | 14 | 15 | 2 | ||||
14. L. viator isolate VxC2 | JN872450 | 29 | 30 | 32 | 65 | 29 | 30 | 29 | 28 | 5 | 12 | 13 | 0 | 2 | |||
15. L. viator isolate VxC3 | JN872451 | 29 | 30 | 34 | 66 | 29 | 30 | 29 | 28 | 1 | 12 | 13 | 6 | 8 | 6 | ||
16. L. viator isolate LVX2 | JN614397 | 28 | 29 | 33 | 66 | 28 | 29 | 28 | 27 | 0 | 11 | 12 | 5 | 7 | 5 | 1 |