Skip to main content

Table 1 The annotated mitochondrial genome of the four cestodes

From: The complete mitochondrial DNA of three monozoic tapeworms in the Caryophyllidea: a mitogenomic perspective on the phylogeny of eucestodes

Gene

Position

Size

Intergenic nucleotides

Codon

Anti-codon

Gene

Position

Size

Intergenic nucleotides

Codon

Anti-codon

From

To

Start

Stop

From

To

Start

Stop

(A) Atractolytocestus huronensis

(B) Breviscolex orientalis

cox3

1

643

643

 

ATG

T

  

1

643

643

 

ATG

T

 

tRNA-His(H)

644

705

62

   

GTG

 

644

707

64

   

GTG

cytb

707

1792

1086

1

ATG

TAA

  

708

1793

1086

 

ATG

TAA

 

nad4L

1792

2052

261

-1

ATG

TAG

  

1793

2053

261

-1

ATG

TAA

 

nad4

2013

3245

1233

-40

ATG

TAG

  

2014

3246

1233

-40

ATG

TAG

 

tRNA-Gln(Q)

3247

3307

61

1

  

TTG

 

3247

3313

67

   

TTG

tRNA-Phe(F)

3304

3367

64

-4

  

GAA

 

3306

3369

64

-8

  

GAA

tRNA-Met(M)

3364

3425

62

-4

  

CAT

 

3364

3424

61

-6

  

CAT

atp6

3427

3942

516

1

ATG

TAA

  

3427

3942

516

2

ATG

TAG

 

nad2

3943

4818

876

 

GTG

TAG

  

3942

4814

873

-1

GTG

TAG

 

tRNA-Val (V)

4819

4879

61

   

TAC

 

4817

4876

60

2

  

TAC

tRNA-Ala (A)

4878

4938

61

-2

  

TGC

 

4875

4936

62

-2

  

TGC

tRNA-Asp(D)

4942

5002

61

3

  

GTC

 

4940

5002

63

3

  

GTC

nad1

5003

5896

894

 

ATG

TAG

  

5005

5898

894

2

ATG

TAG

 

tRNA-Asn(N)

5896

5959

64

-1

  

GTT

 

5898

5960

63

-1

  

GTT

tRNA-Pro(P)

5962

6021

60

2

  

TGG

 

5963

6024

62

2

  

TGG

tRNA-Ile(I)

6021

6084

64

-1

  

GAT

 

6024

6087

64

-1

  

GAT

tRNA-Lys(K)

6085

6143

59

   

CTT

 

6088

6147

60

   

CTT

nad3

6144

6491

348

 

GTG

TAG

  

6148

6498

351

 

GTG

TAG

 

tRNA-Ser(S1)

6489

6545

57

-3

  

GCT

 

6497

6552

56

-2

  

GCT

tRNA-Trp(W)

6547

6608

62

1

  

TCA

 

6555

6618

64

2

  

TCA

cox1

6613

8166

1554

4

ATG

TAG

  

6625

8166

1542

6

ATG

TAG

 

tRNA-Thr(T)

8157

8217

61

-10

  

TGT

 

8157

8219

63

-10

  

TGT

16S

8218

9171

954

     

8220

9166

947

    

tRNA-Cys(C)

9172

9230

59

   

GCA

 

9167

9230

64

   

GCA

12S

9231

9931

701

     

9231

9937

707

    

tRNA-Leu(L1)

9932

9995

64

   

TAG

 

9938

10,002

65

   

TAG

tRNA-Ser(S2)

9998

10,059

62

2

  

TGA

 

10,009

10,072

64

6

  

TGA

tRNA-Leu(L2)

10,060

10,123

64

   

TAA

 

10,075

10,136

62

2

  

TAA

NCR1

10,124

10,996

873

     

10,137

10,344

208

    

cox2

10,997

11,569

573

 

GTG

TAA

  

10,345

10,920

576

 

ATG

TAG

 

tRNA-Glu(E)

11,570

11,640

71

   

TTC

 

10,921

10,987

67

   

TTC

nad6

11,641

12,099

459

 

GTG

TAG

  

10,988

11,446

459

 

GTG

TAG

 

tRNA-Tyr(Y)

12,106

12,171

66

6

  

GTA

 

11,454

11,517

64

7

  

GTA

tRNA-Arg(R)

12,173

12,226

54

1

  

TCG

 

11,519

11,574

56

1

  

TCG

nad5

12,227

13,783

1557

 

GTG

TAG

  

11,577

13,124

1548

2

GTG

TAA

 

tRNA-Gly(G)

13,784

13,847

64

   

TCC

 

13,124

13,186

63

-1

  

TCC

NCR2

13,848

15,130

1283

     

13,187

14,011

825

    

(C) Khawia sinensis

(D) Schyzocotyle acheilognathi (CN)

cox3

1

637

637

 

ATG

T

  

1

655

655

 

ATG

T

 

tRNA-His(H)

638

699

62

   

GTG

 

656

730

75

   

GTG

cytb

701

1822

1122

1

ATG

TAA

  

734

1831

1098

3

ATG

TAG

 

nad4L

1804

2064

261

-19

ATG

TAG

  

1833

2093

261

1

GTG

TAG

 

nad4

2025

3257

1233

-40

ATG

TAA

  

2054

3304

1251

-40

GTG

TAG

 

tRNA-Gln(Q)

3258

3318

61

   

TTG

 

3304

3367

64

-1

  

TTG

tRNA-Phe(F)

3315

3378

64

-4

  

GAA

 

3363

3426

64

-5

  

GAA

tRNA-Met(M)

3374

3436

63

-5

  

CAT

 

3423

3486

64

-4

  

CAT

atp6

3440

3955

516

3

ATG

TAA

  

3490

4005

516

3

ATG

TAG

 

nad2

3960

4832

873

4

ATG

TAG

  

4006

4878

873

 

ATG

TAG

 

tRNA-Val (V)

4835

4894

60

2

  

TAC

 

4883

4948

66

4

  

TAC

tRNA-Ala (A)

4893

4954

62

-2

  

TGC

 

4958

5019

62

9

  

TGC

tRNA-Asp(D)

4960

5024

65

5

  

GTC

 

5025

5087

63

5

  

GTC

nad1

5025

5918

894

 

ATG

TAG

  

5092

5985

894

4

ATG

TAA

 

tRNA-Asn(N)

5918

5984

67

-1

  

GTT

 

5991

6055

65

5

  

GTT

tRNA-Pro(P)

5988

6047

60

3

  

TGG

 

6060

6122

63

4

  

TGG

tRNA-Ile(I)

6047

6110

64

-1

  

GAT

 

6128

6193

66

5

  

GAT

tRNA-Lys(K)

6117

6177

61

6

  

CTT

 

6198

6259

62

4

  

CTT

nad3

6178

6523

346

 

ATG

T

  

6264

6608

345

4

ATG

TAA

 

tRNA-Ser(S1)

6524

6578

55

   

TCT

 

6607

6665

59

-2

  

GCT

tRNA-Trp(W)

6579

6641

63

   

TCA

 

6666

6729

64

   

TCA

cox1

6646

8196

1551

4

ATG

TAG

  

6742

8328

1587

12

ATG

TAG

 

tRNA-Thr(T)

8187

8247

61

-10

  

TGT

 

8342

8404

63

13

  

TGT

        

NCR1

8405

8528

124

    

16S

8248

9193

946

     

8529

9494

966

    

tRNA-Cys(C)

9194

9251

58

   

GCA

 

9495

9555

61

   

GCA

12S

9252

9960

709

     

9556

10,285

730

    

tRNA-Leu(L1)

9961

10,023

63

   

TAG

cox2

10,286

10,858

573

 

ATG

TAA

 

tRNA-Ser(S2)

10,025

10,087

63

1

  

TGA

E

10,862

10,924

63

3

  

TTC

tRNA-Leu(L2)

10,089

10,150

62

1

  

TAA

nad6

10,928

11,383

456

3

ATG

TAA

 

NCR1

10,151

10,699

549

    

L1

11,402

11,465

64

18

  

TAG

cox2

10,700

11,273

574

 

ATG

T

 

L2

11,468

11,531

64

2

  

TAA

tRNA-Glu(E)

11,272

11,332

61

-2

  

TTC

Y

11,539

11,602

64

7

  

GTA

nad6

11,333

11,791

459

 

ATG

TAA

 

S2

11,620

11,685

66

17

  

TGA

tRNA-Tyr(Y)

11,797

11,859

63

5

  

GTA

NCR2

11,686

11,851

166

    

tRNA-Arg(R)

11,872

11,925

54

12

  

TCG

 

11,852

11,909

58

   

TCG

nad5

11,926

13,476

1551

 

ATG

TAA

  

11,913

13,478

1566

3

ATG

TAA

 

tRNA-Gly(G)

13,476

13,537

62

-1

  

TCC

 

13,484

13,547

64

5

  

TCC

NCR2

13,538

14,620

1083

    

NCR3

13,548

14,046

499

   Â