Skip to main content

Table 2 Blastocystis subtypes identified in the present study

From: Distribution of Blastocystis subtypes isolated from humans from an urban community in Rio de Janeiro, Brazil

Subtype No. of isolates Isolate code and GenBank accession number
ST1 23 RTDC1 (KU892242); RTDC4 (KU892241); RTDC5 (KU892222); RTDC8 (KU892243); RTDC17 (KU892244); RTDC27 (KU892225); RTDC29 (KU892233); RTDC32 (KU892227); RTDC35 (KU892237); RTDC36 (KU892229); RTDC37 (KU892235); RTDC38 (KU892236); RTDC39 (KU892230); RTDC40 (KU892238); RTDC41 (KU892231); RTDC42 (KU892240); RTDC49 (KU892232); RTDC50 (KU892226); RTDC52 (KU892239); RTDC55 (KU892234); RTDC56 (KU892228); RTDC60 (KU892223); RTDC66 (KU892224)
ST2 4 RTDC44 (KU892245); RTDC45 (KU892246); RTDC 67 (KU892247); RTDC69 (KU892248)
ST3 27 RTDC2 (KU892249); RTDC 3 (KU892250); RTDC6 (KU892251); RTDC10 (KU892252); RTDC 12 (KU892253); RTDC20 (KU892254); RTDC 22 (KU892255); RTDC23 (KU892256); RTDC 24 (KU892257); RTDC25 (KU892258); RTDC 26 (KU892259); RTDC28 (KU892260); RTDC 30 (KU892261); RTDC31 (KU892262); RTDC 33 (KU892263); RTDC34 (KU892264); RTDC 43 (KU892265); RTDC51 (KU892266); RTDC 54 (KU892267); RTDC57 (KU892268); RTDC 58 (KU892269); RTDC59 (KU892270); RTDC 61 (KU892271); RTDC62 (KU892272); RTDC 63 (KU892273); RTDC64 (KU892274); RTDC 65 (KU892275)
ST4 1 RTDC9 (KU892276)
ST1- ST3a 9 RTDC13; RTDC15; RTDC18; RTDC21; RTDC47; RTDC48; RTDC53; RTDC68; RTDC70
  1. aSubtype-specific sequence-tagged-site (STS) primers