Table 3 Occurrence and distribution of subtypes from Enterocytozoon bieneusi ITS genotypes J and BEB4 at four MLST loci

J

3

MS1-3ⁿ

MS3-1

MS4-2

–

12

MS1-3ⁿ

MS3-1

MS4-2

MS7-1

10

MS1-3ⁿ

MS3-1

MS4-1

–

1

MS1-3ⁿ

MS3-1

–

–

1

MS1-3ⁿ

MS3-1

MS4-1

MS7-1

1

MS1-3ⁿ

MS3-1

MS4-2 and MS4-3

–

1

MS1-3ⁿ

MS3-2

MS4-1

–

1

MS1-3ⁿ

MS3-4ⁿ

MS4-2

MS7-1

1

MS1-2

MS3-2

MS4-1

–

1

MS1-2

–

–

–

1

MS1-4ⁿ

MS3-3ⁿ

MS4-1

–

1

MS1-5ⁿ

MS3-2

MS4-1

MS7-1

1

MS1-5ⁿ

MS3-5ⁿ

MS4-1

MS7-1

1

MS1-6ⁿ

MS3-5ⁿ

MS4-1

–

1

MS1-7ⁿ

MS3-1

MS4-1

–

1

–

MS3-1

MS4-2

–

1

–

MS3-1

–

–

1

–

MS3-2

MS4-1

–

1

4

MS1-8ⁿ

–

MS4-1

–

6

MS1-8ⁿ

–

MS4-1

MS7-1

4

MS1-8ⁿ

–

MS4-1

MS7-2ⁿ

1

MS1-8ⁿ

–

MS4-1

MS7-4ⁿ

1

MS1-8ⁿ

–

–

–

1

MS1-7ⁿ

–

MS4-1

–

1

Noisy

–

MS4-1

–

1

BEB4

1

MS1-1

MS3-2

MS4-2

–

7

MS1-1

MS3-2

MS4-2

MS7-1

4

MS1-1

MS3-2

MS4-2

MS7-3ⁿ

2

–

MS3-2

MS4-2

–

1

–

MS3-2

–

–

1

2

MS1-1

MS3-2

MS4-2

MS7-1

1

5

MS1-1

MS3-2

MS4-2

MS7-1

7

MS1-1

MS3-2

MS4-2

–

7

MS1-1

MS3-2

MS4-2

MS7-3ⁿ

1

Total

84