Skip to main content

Table 4 Multilocus sequence genotypes of Giardia duodenalis in Guangdong, China by season, based on nucleotide sequence analysis of the beta -giardin (bg), triosephosphate isomerase (tpi) and glutamate dehydrogenase (gdh) genes

From: Prevalence and genotypic identification of Cryptosporidium spp., Giardia duodenalis and Enterocytozoon bieneusi in pre-weaned dairy calves in Guangdong, China

MLGsa

Subtype

No. positive

bg

tpi

gdh

Spring

Summer

Winter

MLG-E1

E3

E17

E1

4

17

25

MLG-E2

E3

E17

E3

5

3

13

MLG-E3

E3

E37b

E1

1

1

2

MLG-E4

E3

E37b

E3

3

0

4

MLG-E5

E3

E34

E1

2

0

4

MLG-E6

E3

E34

E3

1

0

3

MLG-E7

E5

E17

E1

2

1

1

MLG-E8

E5

E17

E3

1

0

0

MLG-E9

E4

E17

E3

1

0

1

MLG-E10

E8

E17

E3

1

0

1

MLG-E11

E4

E17

E1

1

0

1

MLG-E12

E9

E17

E1

1

0

2

MLG-E13

E5

E36b

E3

1

0

0

MLG-E14

E18b

E17

E3

1

0

0

MLG-E15

E9

E34

E1

1

0

0

MLG-E16

E9

E17

E3

1

0

1

MLG-E17

E9

E37b

E1

0

0

1

MLG-E18

E9

E1

E3

0

0

2

MLG-E19

E9

E37b

E3

0

0

1

MLG-E20

E3

E1

E1

0

0

3

MLG-E21

E5

E36b

E3

1

0

0

MLG-E22

E7

E17

E3

1

0

0

MLG-E23

E3

E17

E29

0

1

0

MLG-E24

E3

E17

E39b

0

1

0

MLG-E25

E5

E34

E1

0

0

1

MLG-E26

E8

E35b

E3

1

0

0

MLG-E27

E3

E35b

E3

0

1

0

MLG-E28

E8

E35b

E1

0

0

1

MLG-E29

E8

E37b

E1

0

0

1

MLG-E30

E4

E37b

E3

0

0

1

MLG-E31

E3

E42b

E1

0

0

2

MLG-E32

E3

E17

E40b

0

0

1

MLG-E33

E3

E17

E41

0

0

1

MLG-E34

E4

E1

E1

0

0

1

MLG-E35

E3

E1

E3

0

0

1

MLG-E36

E8

E1

E1

0

0

1

MLG-E37

E3

E39b

E3

1

0

0

MLG-E38

E3

E45b

E3

0

0

1

MLG-E39

E8

E42b

E1

0

0

1

MLG-E40

E8

E41b

E3

0

0

1

MLG-E41

E3

E46b

E1

0

0

1

MLG-E42

E4

E43b

E1

0

0

1

MLG-E43

E26b

E17

E3

0

0

1

MLG-E44

E3

E43b

E3

0

0

1

MLG-E45

E7

E44b

E1

0

0

1

MLG-E46

E7

E1

E1

0

0

1

MLG-E47

E7

E37b

E1

0

0

1

MLG-E48

E3

E45b

E1

0

0

1

MLG-E49

E4

E17

E37

1

0

0

MLG-AI

A1

A1

A1

1

0

0

  1. aMLGs were named based on sequence types at the bg, tpi and gdh locus. No attempts were made to consolidate MLG names of assemblage E among studies because of the extensive genetic heterogeneity within the G. duodenalis genotype
  2. bNovel subtype