Skip to main content

Table 4 Multilocus sequence genotypes of Giardia duodenalis in Guangdong, China by season, based on nucleotide sequence analysis of the beta -giardin (bg), triosephosphate isomerase (tpi) and glutamate dehydrogenase (gdh) genes

From: Prevalence and genotypic identification of Cryptosporidium spp., Giardia duodenalis and Enterocytozoon bieneusi in pre-weaned dairy calves in Guangdong, China

MLGsa Subtype No. positive
bg tpi gdh Spring Summer Winter
MLG-E1 E3 E17 E1 4 17 25
MLG-E2 E3 E17 E3 5 3 13
MLG-E3 E3 E37b E1 1 1 2
MLG-E4 E3 E37b E3 3 0 4
MLG-E5 E3 E34 E1 2 0 4
MLG-E6 E3 E34 E3 1 0 3
MLG-E7 E5 E17 E1 2 1 1
MLG-E8 E5 E17 E3 1 0 0
MLG-E9 E4 E17 E3 1 0 1
MLG-E10 E8 E17 E3 1 0 1
MLG-E11 E4 E17 E1 1 0 1
MLG-E12 E9 E17 E1 1 0 2
MLG-E13 E5 E36b E3 1 0 0
MLG-E14 E18b E17 E3 1 0 0
MLG-E15 E9 E34 E1 1 0 0
MLG-E16 E9 E17 E3 1 0 1
MLG-E17 E9 E37b E1 0 0 1
MLG-E18 E9 E1 E3 0 0 2
MLG-E19 E9 E37b E3 0 0 1
MLG-E20 E3 E1 E1 0 0 3
MLG-E21 E5 E36b E3 1 0 0
MLG-E22 E7 E17 E3 1 0 0
MLG-E23 E3 E17 E29 0 1 0
MLG-E24 E3 E17 E39b 0 1 0
MLG-E25 E5 E34 E1 0 0 1
MLG-E26 E8 E35b E3 1 0 0
MLG-E27 E3 E35b E3 0 1 0
MLG-E28 E8 E35b E1 0 0 1
MLG-E29 E8 E37b E1 0 0 1
MLG-E30 E4 E37b E3 0 0 1
MLG-E31 E3 E42b E1 0 0 2
MLG-E32 E3 E17 E40b 0 0 1
MLG-E33 E3 E17 E41 0 0 1
MLG-E34 E4 E1 E1 0 0 1
MLG-E35 E3 E1 E3 0 0 1
MLG-E36 E8 E1 E1 0 0 1
MLG-E37 E3 E39b E3 1 0 0
MLG-E38 E3 E45b E3 0 0 1
MLG-E39 E8 E42b E1 0 0 1
MLG-E40 E8 E41b E3 0 0 1
MLG-E41 E3 E46b E1 0 0 1
MLG-E42 E4 E43b E1 0 0 1
MLG-E43 E26b E17 E3 0 0 1
MLG-E44 E3 E43b E3 0 0 1
MLG-E45 E7 E44b E1 0 0 1
MLG-E46 E7 E1 E1 0 0 1
MLG-E47 E7 E37b E1 0 0 1
MLG-E48 E3 E45b E1 0 0 1
MLG-E49 E4 E17 E37 1 0 0
MLG-AI A1 A1 A1 1 0 0
  1. aMLGs were named based on sequence types at the bg, tpi and gdh locus. No attempts were made to consolidate MLG names of assemblage E among studies because of the extensive genetic heterogeneity within the G. duodenalis genotype
  2. bNovel subtype