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Table 2 Overview of molecular identifications

From: Molecular analysis reveals a high diversity of Anopheles species in Karama, West Sulawesi, Indonesia

Sequence group

No. of samples (ITS2; cox1)

Sequence length in bp (ITS2; cox1)

ITS2 homology (%ID)

Cox1 homology (%ID)

Final ID

AN1

23; 20

515; 651

An. aconitus (98.6)

An. aconitus (95.9)

An. aconitus

AN2

1; 1

495; 327

An. karwari (98.7)

An. karwari (97.7)

An. karwari

AN3

113; 29

524; 698

An. peditaeniatus (100)

An. peditaeniatus (99.5)

An. peditaeniatus

AN4

29; 29

658; 697

An. vagus (98.6)

An. vagus (96.6)

An. vagus

AN5

275; 35

640; 697

An. vagus (99.8)

An. vagus (96.6)

An. vagus

AN6

1305; 222

1470; 704

An. barbirostris (97.2)

An. barbirostris (98.6)

An. barbirostris

AN7

35; 28

592; 643

An. tessellatus (96.8)

An. tessellatus (95.6)

An. tessellatus

AN8

233; 43

592; 652

An. nigerrimus (96.7)

An. nitidus (96.1)

An. nigerrimus

AN9

47; 39

503; 628

An. flavirostris (99.8)

An. flavirostris (98.9)

An. flavirostris

503; 643

An. flavirostris (98.95)

AN10

5; 4

534; 630

An. sinensis (97.9)

An. crawfordi (97.1)

An. crawfordi

AN11

28; 25

450; 643

An. maculatus (95.4)

An. maculatus (95.9)

An. maculatus

AN12

7; 4

491; 631

An. kochi (99.4)

An. kochi (100)

An. kochi

AN13

32; 29

617; 679

An. saeungae (9.0)

An. sp. 14 (91.7)

Myzorhynchus Series

AN14

140; 40

420; 689

An. bancroftii genotype B (93.3)

An. coustani (92.1)

Myzorhynchus Series

420; 636

An. farauti (92.3)

Neomyzomyia Series

AN15

5; 4

381; 689

An. bancroftii genotype B (91.5)

An. coustani (92.0)

Myzorhynchus Series

AN16

1; 1

615; 616

An. subpictus (78.6)

An. albitarsis E (91.5)

Genus Anopheles

AN17

277; 72

569; 717

An. sundaicus (80.7)

An. albitarsis (91.4)

Genus Anopheles

AN18

60; 52

589; 689

An. tessellatus (88.1)

An. lutzii (92.0)

Genus Anopheles

  1. Table represents the 2616 total ITS2 sequences and the corresponding 677 cox1 sequences. Final species identifications are based on both ITS2 and cox1 comparisons.  % ID is the percentage identity based on BLAST database comparison. Final species identification, when not to specific species, was based on the lowest common taxonomic identity for the paired ITS2 and cox1 sequences