Skip to main content

Table 2 Overview of molecular identifications

From: Molecular analysis reveals a high diversity of Anopheles species in Karama, West Sulawesi, Indonesia

Sequence group No. of samples (ITS2; cox1) Sequence length in bp (ITS2; cox1) ITS2 homology (%ID) Cox1 homology (%ID) Final ID
AN1 23; 20 515; 651 An. aconitus (98.6) An. aconitus (95.9) An. aconitus
AN2 1; 1 495; 327 An. karwari (98.7) An. karwari (97.7) An. karwari
AN3 113; 29 524; 698 An. peditaeniatus (100) An. peditaeniatus (99.5) An. peditaeniatus
AN4 29; 29 658; 697 An. vagus (98.6) An. vagus (96.6) An. vagus
AN5 275; 35 640; 697 An. vagus (99.8) An. vagus (96.6) An. vagus
AN6 1305; 222 1470; 704 An. barbirostris (97.2) An. barbirostris (98.6) An. barbirostris
AN7 35; 28 592; 643 An. tessellatus (96.8) An. tessellatus (95.6) An. tessellatus
AN8 233; 43 592; 652 An. nigerrimus (96.7) An. nitidus (96.1) An. nigerrimus
AN9 47; 39 503; 628 An. flavirostris (99.8) An. flavirostris (98.9) An. flavirostris
503; 643 An. flavirostris (98.95)
AN10 5; 4 534; 630 An. sinensis (97.9) An. crawfordi (97.1) An. crawfordi
AN11 28; 25 450; 643 An. maculatus (95.4) An. maculatus (95.9) An. maculatus
AN12 7; 4 491; 631 An. kochi (99.4) An. kochi (100) An. kochi
AN13 32; 29 617; 679 An. saeungae (9.0) An. sp. 14 (91.7) Myzorhynchus Series
AN14 140; 40 420; 689 An. bancroftii genotype B (93.3) An. coustani (92.1) Myzorhynchus Series
420; 636 An. farauti (92.3) Neomyzomyia Series
AN15 5; 4 381; 689 An. bancroftii genotype B (91.5) An. coustani (92.0) Myzorhynchus Series
AN16 1; 1 615; 616 An. subpictus (78.6) An. albitarsis E (91.5) Genus Anopheles
AN17 277; 72 569; 717 An. sundaicus (80.7) An. albitarsis (91.4) Genus Anopheles
AN18 60; 52 589; 689 An. tessellatus (88.1) An. lutzii (92.0) Genus Anopheles
  1. Table represents the 2616 total ITS2 sequences and the corresponding 677 cox1 sequences. Final species identifications are based on both ITS2 and cox1 comparisons.  % ID is the percentage identity based on BLAST database comparison. Final species identification, when not to specific species, was based on the lowest common taxonomic identity for the paired ITS2 and cox1 sequences