Table 3 Allelic richness, heterozygosity, fixation and inbreeding indices for 12 microsatellite loci in populations of An. funestus collected from Malawi, Mozambique, Zambia, Zimbabwe and Uganda
Index | Na | Ho | He | FST | FIS | Na | Ho | He | FST | FIS | Na | Ho | He | FST | FIS | Na | Ho | He | FST | FIS |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Locus | FUNQ (X) | FUNL (2L) | AFUB10 (2L) | AFUB11 (2L) | ||||||||||||||||
Malawi (n = 60) | 4.67 | 0.12 | 0.76 | 0.20 | 1.00 | 7 | 0.37 | 0.82 | 0.13 | 0.44 | 8.67 | 0.27 | 0.84 | − 0.02 | 0.68 | 6.00 | 0.00 | 0.80 | − 0.06 | 1.00 |
Mozambique (n = 70) | 3.00 | 0.34 | 0.56 | 0.06 | 0.33 | 7.5 | 0.61 | 0.82 | 0.02 | 0.18 | 4.00 | 0.60 | 0.75 | 0.01 | − 0.21 | na | na | na | na | na |
Uganda (n = 63) | 3.25 | 0.00 | 0.63 | 0.10 | 1.00 | 6.25 | 0.60 | 0.76 | 0.13 | − 0.22 | 5.75 | 0.05 | 0.72 | − 0.02 | 0.82 | 4.25 | 0.13 | 0.62 | 0.02 | 0.69 |
Zambia (n = 60) | 3.00 | 0.17 | 0.61 | 0.00 | 0.81 | 12 | 0.58 | 0.86 | − 0.02 | 0.21 | na | na | na | na | na | 16.50 | 0.48 | 0.89 | 0.04 | 0.39 |
Zimbabwe (n = 70) | 5.00 | 0.06 | 0.73 | 0.21 | 0.93 | 4 | 0.23 | 0.67 | − 0.02 | 0.39 | 6.00 | 0.15 | 0.73 | 0.01 | 0.67 | 13.00 | 0.38 | 0.86 | 0.02 | 0.55 |
Locus | FUNF (2R) | FUNO (2R) | AFND23 (2R) | AFUB3 (2R) | ||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Malawi (n = 60) | 4.67 | 0.49 | 0.70 | − 0.02 | − 0.05 | 5.33 | 0.47 | 0.73 | 0.04 | 0.11 | 3.67 | 0.27 | 0.68 | 0.05 | 0.16 | 5.33 | 0.95 | 0.71 | − 0.02 | − 0.64 |
Mozambique (n = 70) | 3.00 | 0.23 | 0.65 | 0.16 | 0.43 | 5.50 | 0.39 | 0.71 | 0.25 | 0.45 | 6.00 | 0.43 | 0.75 | 0.11 | 0.18 | 11.00 | 0.46 | 0.70 | 0.01 | − 0.08 |
Uganda (n = 63) | 5.00 | 0.14 | 0.73 | 0.04 | 0.68 | 7.25 | 0.46 | 0.82 | 0.04 | 0.31 | 9.50 | 0.66 | 0.83 | 0.02 | 0.10 | 8.00 | 0.51 | 0.85 | 0.01 | 0.35 |
Zambia (n = 60) | 3.00 | 0.00 | 0.65 | 0.00 | 0.82 | 9.00 | 0.37 | 0.81 | 0.01 | 0.49 | 6.50 | 0.43 | 0.80 | 0.00 | 0.25 | 13.50 | 0.52 | 0.86 | − 0.01 | 0.28 |
Zimbabwe (n = 70) | 6.50 | 0.41 | 0.66 | 0.03 | − 0.36 | 6.00 | 0.33 | 0.72 | 0.09 | 0.22 | 7.00 | 0.37 | 0.76 | 0.03 | 0.19 | 9.50 | 0.28 | 0.65 | − 0.02 | 0.42 |
Locus | AFUB12 (3L) | AFND19 (3R) | AFND20 (3R) | AFNB41 (3R) | ||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Malawi (n = 60) | 11.67 | 0.36 | 0.89 | 0.00 | 0.57 | 3.00 | 0.00 | 0.61 | 0.10 | 0.78 | 11.33 | 0.36 | 0.87 | − 0.01 | 0.56 | 9.67 | 0.20 | 0.87 | 0.01 | 0.73 |
Mozambique (n = 70) | 8.50 | 0.63 | 0.76 | 0.17 | 0.16 | 3.50 | 0.13 | 0.64 | 0.15 | 0.71 | 7.00 | 0.74 | 0.76 | − 0.02 | 1.00 | 3.50 | 0.00 | 0.34 | − 0.01 | − 0.18 |
Uganda (n = 63) | 10.25 | 0.45 | 0.88 | 0.02 | 0.43 | 3.50 | 0.30 | 0.61 | 0.23 | 0.06 | 8.25 | 0.16 | 0.85 | 0.00 | 0.78 | 11.00 | 0.49 | 0.91 | 0.00 | 0.39 |
Zambia (n =60) | 11.00 | 0.47 | 0.84 | 0.12 | 0.36 | 3.00 | 0.22 | 0.50 | 0.02 | − 0.17 | 8.00 | 0.17 | 0.79 | 0.03 | 0.83 | 9.00 | 0.45 | 0.84 | 0.00 | 0.28 |
Zimbabwe (n = 70) | 11.00 | 0.39 | 0.84 | − 0.02 | 0.36 | 7.50 | 0.16 | 0.82 | 0.08 | 0.71 | 7.00 | 0.23 | 0.82 | 0.01 | 0.62 | na | na | na | na | na |